Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33bP59016 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms