Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5bP56480 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp5bP56480 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms