Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp5P56399 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp5P56399 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms