Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pex2P55098 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms