Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a1P55014 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a1P55014 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a1P55014 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms