Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CebpaP53566 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpaP53566 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpaP53566 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpaP53566 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms