Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec1P51908 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec1P51908 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apobec1P51908 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms