Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanccP50652 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanccP50652 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FanccP50652 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanccP50652 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FanccP50652 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanccP50652 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanccP50652 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanccP50652 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanccP50652 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanccP50652 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanccP50652 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanccP50652 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanccP50652 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FanccP50652 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanccP50652 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanccP50652 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanccP50652 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms