Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms