Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LtbrP50284 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms