Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epb42P49222 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Epb42P49222 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Epb42P49222 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms