Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rplp1P47955 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms