Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igfbp3P47878 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igfbp3P47878 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms