Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3caP42337 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3caP42337 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms