Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms