Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ThpoP40226 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ThpoP40226 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms