Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppm1bP36993 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppm1bP36993 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppm1bP36993 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms