Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms