Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd247P24161 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms