Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Hoxd12P23812 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd12P23812 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd12P23812 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms