Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsta3P23591 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsta3P23591 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsta3P23591 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsta3P23591 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsta3P23591 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms