Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PparaP23204 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PparaP23204 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PparaP23204 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PparaP23204 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PparaP23204 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PparaP23204 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PparaP23204 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PparaP23204 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PparaP23204 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PparaP23204 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PparaP23204 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PparaP23204 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PparaP23204 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PparaP23204 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms