Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3aP23116 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3aP23116 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3aP23116 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms