Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f1P21952 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms