Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfaP20033 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfaP20033 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms