Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox5bP19536 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox5bP19536 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox5bP19536 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms