Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifrd1P19182 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms