Protein–RNA interactions for Protein: P17439

Gba, Glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GbaP17439 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GbaP17439 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GbaP17439 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GbaP17439 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GbaP17439 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GbaP17439 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GbaP17439 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GbaP17439 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GbaP17439 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GbaP17439 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GbaP17439 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GbaP17439 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GbaP17439 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms