Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna1P16388 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna1P16388 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms