Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnni2P13412 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnni2P13412 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni2P13412 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms