Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FosbP13346 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FosbP13346 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FosbP13346 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FosbP13346 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FosbP13346 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FosbP13346 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FosbP13346 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FosbP13346 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FosbP13346 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FosbP13346 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FosbP13346 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FosbP13346 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FosbP13346 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FosbP13346 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FosbP13346 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FosbP13346 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FosbP13346 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FosbP13346 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FosbP13346 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms