Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a1P12813 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms