Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtcP11725 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OtcP11725 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtcP11725 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtcP11725 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OtcP11725 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OtcP11725 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OtcP11725 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OtcP11725 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OtcP11725 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OtcP11725 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OtcP11725 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OtcP11725 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OtcP11725 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OtcP11725 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OtcP11725 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OtcP11725 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OtcP11725 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OtcP11725 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OtcP11725 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms