Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms