Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GzmbP04187 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms