Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01659 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01659 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01659 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01659 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01659 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01659 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01659 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms