Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpdO89001 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpdO89001 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpdO89001 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpdO89001 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpdO89001 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpdO89001 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpdO89001 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpdO89001 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpdO89001 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpdO89001 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CpdO89001 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CpdO89001 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpdO89001 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpdO89001 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpdO89001 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpdO89001 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpdO89001 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CpdO89001 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpdO89001 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpdO89001 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CpdO89001 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CpdO89001 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CpdO89001 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CpdO89001 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CpdO89001 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpdO89001 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms