Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BlmO88700 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BlmO88700 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BlmO88700 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BlmO88700 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BlmO88700 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BlmO88700 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BlmO88700 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BlmO88700 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BlmO88700 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BlmO88700 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BlmO88700 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BlmO88700 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BlmO88700 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BlmO88700 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BlmO88700 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BlmO88700 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BlmO88700 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BlmO88700 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BlmO88700 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BlmO88700 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BlmO88700 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BlmO88700 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms