Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30O88574 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30O88574 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30O88574 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30O88574 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30O88574 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30O88574 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms