Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops6O88545 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops6O88545 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops6O88545 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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