Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt1O88346 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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