Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfdp1O88271 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms