Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb5O55234 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb5O55234 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb5O55234 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms