Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms