Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35aO55142 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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