Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26a1O55127 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp26a1O55127 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms