Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrxO55103 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrxO55103 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrxO55103 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PrxO55103 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PrxO55103 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrxO55103 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrxO55103 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrxO55103 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrxO55103 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrxO55103 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrxO55103 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrxO55103 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrxO55103 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrxO55103 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrxO55103 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrxO55103 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrxO55103 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrxO55103 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrxO55103 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrxO55103 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrxO55103 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrxO55103 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrxO55103 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrxO55103 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrxO55103 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrxO55103 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrxO55103 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PrxO55103 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrxO55103 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrxO55103 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrxO55103 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrxO55103 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrxO55103 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrxO55103 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrxO55103 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrxO55103 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrxO55103 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PrxO55103 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrxO55103 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrxO55103 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrxO55103 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms