Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3O55013 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3O55013 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms