Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb3O54890 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Itgb3O54890 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb3O54890 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms