Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DffaO54786 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DffaO54786 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DffaO54786 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DffaO54786 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DffaO54786 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DffaO54786 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DffaO54786 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DffaO54786 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DffaO54786 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DffaO54786 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DffaO54786 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DffaO54786 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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